博士生导师

课题组主要研究领域为蛋白质探针的活细胞递送及在体应用、活性多肽的化学改性等，具体方向如下：
1.泛素家族蛋白质化学探针的合成、蛋白质组学及生物化学应用
2.基于蛋白-细胞穿透肽(CPP)多价静电互作的活细胞递送
3.药物、食品中活性多肽的结构改性
硕士招生方向：有机化学、生物化学、药学
博士招生方向：有机化学、生物化学、细胞生物学
课题组每年均有稳定的学术博士与工程博士招生指标，欢迎热爱基础研究的学生报考。

近年来，共主持多项国家自然基金项目及省部级人才项目，主要如下：
1.“基于骨架改性化学的蛋白质化学全合成仪器研制”，国家自然科学基金重大科研仪器研制项目，2023.01-2027.12，合作单位负责人；
2.“广谱抗菌XX素智能设计与高效制备技术”，国防生物交叉重大优先方向重点项目，2025.03-2027.03, 项目负责人；
3.“穿梭活细胞的蛋白质化学探针”，安徽省自然科学基金杰青延续资助项目，2025.09-2028.08，项目负责人；
4.“酶促蛋白质半合成新方法”, 安徽省自然科学基金杰青项目，2022.01-2024.12，项目负责人；
5.“细胞区室靶向的原位激活泛素工具蛋白的化学合成与应用”，国家自然科学基金面上项目，2023.01-2026.12，项目负责人；
6.“非经典泛素修饰蛋白的化学合成及应用”，国家自然科学基金重大研究计划重点项目，2018.01-2021.12, 合作单位负责人；
7.“泛素化肿瘤抑制因子p53 的化学合成及特异性去泛素化研究”，国家自然科学基金面上项目，2019.01-2022.12, 项目负责人；
8.“毒素蛋白探针的化学合成及其生物学应用”，国家自然科学基金面上项目，2016.01-2017.12, 项目负责人；
9.“转肽酶Sortase A催化的新反应及其在蛋白质修饰中的应用”，国家自然科学基金面上项目，2014.01-2017.12，项目负责人。

以通讯作者共发表研究论文60余篇，包括Nature Chem. Biol.、Nature Commun.、J. Am. Chem. Soc.、Angew. Chem. Int. Ed.、JACS Au、CCS Chem.等，
近年来主要代表作如下：
1.Wang, Y.; Fan, J.; Meng, X.; Shu, Q.; Wu, Y.; Chu, G.; Ji, R., Ye, Y. S.; Wu, X. W.; Shi, J.; Deng, H.; Liu, L.*; Li, Y.-M.* Development of nucleus-targeted histone-tail-based photoaffinity probes to profile the epigenetic interactome in native cells. Nature Commun. 2025, 16, 415.
2.Wang, Y.; Liu, L.; Zheng, Q.Y.; Wu, Y.; Su, Z.; Yuan, R.J.; Xia, Q.; Wang, B.; Yu, Y.;* Li, Y.-M.* Synergizing Structure-Guided Photocaged Linear Diubiquitin-Dha with Biotinylated Linear-Fab for Time-Resolved Profiling of Interactors in Living Cells. J. Am. Chem. Soc. 2025, doi.org/10.1021/jacs.5c15159.
3.Zhao R., Shi P., Cui J. B., Shi C. W., Wei X. X., Luo J., Xia Z. M., Shi W. W., Zhou Y. X., Tang J. H., Tian C. L., Meininghaus M., Bierer D., Shi J.*, Li Y.-M.*, Liu L.*, Single-Shot Solid-Phase Synthesis of Full-Length H2 Relaxin Disulfide Surrogates. Angew. Chem. Int. Ed. 2023, 62, e202216365.
4.Chu, G. C.; Li, Y.-M.* Lighting up kinase contacts in situ. Nature Chem. Biol. 2024, 20, 544.
5.Wang, Y.; Chen, J. N.; Hua, X.; Meng, X. B.; Cai, H. Y.; Wang, R. T.; Shi, J.; Deng, H. T.; Liu, L.; Li, Y.-M.* Photocaging of Cell-permeable Activity-based Ubiquitin Probes via a C-Terminal Backbone Modification Strategy. Angew. Chem. Int. Ed. 2022, 61, e202203792.
6.Zheng, Q. Y.; Wang, T.; Chu, G. C.; Zuo, C.; Zhao, R.; Sui X.; Ye, L.; Yu, Y., Chen, J Zhang, W.; Deng, H.; Shi, J.; Pan, M.*; Li, Y.-M.*; Liu, L.* An E1-Catalyzed Chemoenzymatic Strategy to Isopeptide-N-Ethylated Deubiquitylase-Resistant Ubiquitin Probes, Angew. Chem. Int. Ed. 2020, 59, 13496.
7.Wang, Y.; Chen, C. C.; Meng, X.; Fan, J.; Pan, M.; Chen, J; Deng, H.; Shi, J.*; Liu, L.; Li, Y.-M.* Chemical Synthesis of diSUMO Photoaffinity Probes for the Identification of PolySUMO-Chain Specific Interacting Proteins. CCS Chem. 2020, 3, 1157.
8.Chu, G. C.; Pan, M.; Li, J.; Liu, S.; Zuo, C.; Tong, Z.-B.; Bai, J.-S.; Gong, Q.; Ai, H.; Fan, J.; Meng, X.; Huang, Y.; Shi, J.; Deng, H.; Tian, C.*; Li, Y.-M.*; Liu, L.* Cysteine-Aminoethylation Assisted Chemical Ubiquitination of Recombinant Histones, J. Am. Chem. Soc. 2019, 141, 3654.
9.Li, Y. T.; Yi, C.; Chen, C. C.; Lan, H.; Pan, M.; Zhang, S. J.; Huang, Y. C.; Guan, C. J.; Li, Y.-M.*; Yu, L.*; Liu, L.* A semisynthetic Atg3 reveals that acetylation promotes Atg3 membrane binding and Atg8 lipidation. Nature Commun. 2017, 8, 14846.
专利
1. 链间二硫键CysA24-CysB23替代为硫醚键的H2 Relaxin衍生物，专利授权号：2022 1 1323902.X
2.一种口腔鳞状细胞癌诊断生物标志物hsa-miR-331-3p及其应用，专利授权号：2024 1 1441126.2
3.一种新型环状聚精氨酸穿膜肽分子及其合成方法和应用，专利授权号：202110526684.9
4.一种简易合成泛素探针Ub-Rho110-Gly的方法，专利授权号：201910179861.3
5.一种用于二泛素合成的新型辅基连接臂及其合成方法和应用，专利授权号：201910025364.8
6.一种环保型正交保护的二氨基二酸类化合物、其制备方法及其应用，专利授权号：201710498209.9
著作
《化学生物学实验》，中国科学技术大学出版社 编委

1.2020年获“蛋白质合成与多肽化学贡献奖”
2.2021年入选国家级青年人才计划
3.2024年获“青年多肽科学家奖”